Günther Zäpfel hat an der Technischen Universität Karlsruhe Technische Betriebswirtschaftslehre studiert. Nach wissenschaftlicher Assistenz am Institut für Fertigungswirtschaft und Arbeitswissenschaft der Universität Karlsruhe erfolgte die Promotion und Habilitation. Zudem war Zäpfel Akademischer Rat am Institut für Fertigungswirtschaft und Arbeitswissenschaft der Universität Karlsruhe und O. Univ.-Prof. an der Universität Linz sowie Vorstand des Instituts für Produktions- und Logistikmanagement (1974–2010). Rufe auf eine Professur an die Universität Passau sowie an die Universität zu Köln und an die Universität Wien. Zäpfel ist Vorsitzender der wissenschaftlichen Kommission »Produktionswirtschaft« im Verband der Hochschullehrer für Betriebswirtschaftslehre e.V. Zäpfel hatte Gastprofessuren an der Technischen Universität Chemnitz und war Visiting Professor an der Privathochschule WHU Koblenz-Vallendar sowie Lehraufträge an der Universität Passau, an der Universität Köln und der Universität Sankt Gallen.
